質問ありがとうございます。
小説の場合で話します。
新着非表示は投稿、コメント、設定変更などが更新された時にトップ画面の 小説 の部分に自分の小説を表示しないことで、
ランキング非表示は、トップ画面の 人気の小説 の欄にその小説を表示しない、というものです。
基本的にnmmnはどちらも非表示に設定することがマナーですので投稿する際はそうしてください。
この説明でわかっていただけたでしょうか？