両親の事件の真実が明るみになり、晴れて殺し屋K（シラサカ）と同じ裏社会の組織ハナムラの一員となった大悟（カナリア）は、組織のボス花村の命令で高校へ編入し、恋人のシラサカ（K）とラブラブな毎日を送っていたが、大悟（カナリア）の元に過去の事件を取材に記者がやってきて……（第一部）
警視総監草薙が何者かに刺されて負傷。入院を拒む彼はふたりの住まいで療養することになってしまったが……（第二部）
今作のサブタイトルはカナリア高校編。一部と二部は繋がっているため、ひとつの作品としています。
★R回はタイトルに（R）をつけてあります★

①シラカナ出会い編「死神の救済～少年がカナリアに変わるまで～」
②カナリア誕生編「Darkness Shine～カナリアが死神に変わるまで～」の続きとなります。